第一次

约1810年代，最初的圣杯战争打响。 [4]

最开始时，这第一次的圣杯召唤仪式以“合作召唤”的形式进行的。然而在圣杯打开了与魔力源泉的接连之后，事态却演变成远坂和爱因兹贝伦家族、玛奇里家族相互争夺独占的权力，结果立刻以失败告终。从此三大家族组成圣杯盟约，立下沿用至今的规则，叫来其他的魔术师，然后让他们以圣杯为目的相互残杀——除了自己以外，能够召唤出英灵的魔术师全部都是妨碍者，让他们在战斗中死去就行了——如果一开始抱有的是这样的想法的话，整个运作过程的效率也会更好；而以三大家族的立场来看，能够合法的收拾掉自己以外的魔术师未尝不是件好事。

但由于事先没有正式订下规则，Master作为“参加者”的意识稀薄；另一方面，由于没有后来现在那样的令咒，所以出现从者不服从命令的情况等原因，这次圣杯召唤尚未形成仪式的外形就失败了。

圣杯降临地点是圆藏山柳洞寺地下大空洞 [4]。

参加者如下

羽斯缇萨·里姿莱希·冯·爱因兹贝伦(Justeaze Lizrich von Einzbern)

远坂永人

玛奇里·佐尔根(Zouken Makiri)

见证者：基修亚·泽尔里奇·修拜因奥古

第二次

约1870年代，工业革命后的圣杯战争。鉴于第一次的失败而规划出细节规则才举行的一届。虽然“令咒系统”完成，Master能够随意使役从者，但因诸多原因仪式却以失败告终。

圣杯降临地点是远坂府邸。 [4]

第三次

约1930年代，在第二次世界大战前夕举行的一届。帝国陆军和纳粹也围绕着小圣杯掺了进来，以帝都为舞台展开了战斗。监督者：言峰璃正。

《Fate/stay night》和《Fate/Zero》世界中

这是历届圣杯战争的转折点。爱因兹贝伦家召唤出了规格外职阶Avenger的英灵安哥拉曼纽，但是Avenger却意外地弱小如普通人，在圣杯战争开始后第四天就死亡了，灵魂被回收进大圣杯。大圣杯的无色之力被以恶之愿望成型的Avenger污染成黑泥。

圣杯战争因小圣杯被破坏而失败。圣杯降临地点是冬木教会。大圣杯被通过小圣杯吸收安哥拉曼纽污染。因此圣杯发生了决定性、根本上的变质。虽然这次圣杯战争是“作废比赛”，但“大圣杯的污染”这一结果继续为下届以后的战争带来影响。 [4]

据《Fate/hollow ataraxia》里讲述：

艾德费尔特家某代双子当主曾前往冬木参与第三次圣杯战争，以Saber作为从者。

由于家族魔术的特点，艾德费尔特的Master拥有两名Saber，分别是该Servant的光暗两面。在第四日，双子击败爱因兹贝伦家的御主和从者——安哥拉曼纽。

在第三次圣杯战争后期，妹妹被时任远坂家主(远坂爷爷)击败，据悉已经战死。在当时“击败”的艾德费尔特妹，不论生死都没有回到芬兰，(实则与远坂的爷爷两情相悦，选择留在了日本)。姐姐则生还，退出圣杯战争后发誓永不踏上日本的土地。

艾德费尔特家的后人因此厌恶日本人，尤其是远坂家。

《Fate/Apocrypha》中

在第三次圣杯战争，爱因兹贝伦召唤了Ruler天草四郎时贞而不是Avenger安哥拉曼纽。Ruler也的确存活到了最后接触了圣杯，但是却没有胜利。

纳粹介入，御三家全部衰弱。大圣杯在随后被纳粹转移。Ruler天草四郎时贞在第三次圣杯战争的最后接触了大圣杯而获得了肉身，并成为监督者言峰璃正的养子，成为圣堂教会第八秘迹会的神父。。圣杯战争的系统也随着御三家的衰弱而泄露，世界各地展开亚种圣杯战争。

御三家和冬木方面，爱因兹贝伦家没有能力再造出大圣杯，但一直在为此而努力。

卫宫切嗣没有和爱因兹贝伦家合作；间桐家完全没落；远坂家则回到了初代远坂永人的魔术武术结合的方式上，双马尾的姐姐远坂凛成为了魔拳师，而妹妹樱被过继给了时臣母亲的娘家艾德费尔特家，和金钻头义姐露维亚瑟琳塔·艾德费尔特组成了职业摔跤手组合。

士郎没有改变自己的姓氏，在冬木过着快乐的校园生活。

【以下为F/AM本里的追加设定】

【其他】第三次圣杯战争

在冬木举办的第三次圣杯战争。活用第一次和第二次的失败经验，开始从圣堂教会派遣监督者等制度所达成的现代冬木市圣杯战争。

本作Fate/Apocrypha与原作Fate/stay night在这个时间点产生分歧，也就是从爱因兹贝伦要挑选Ruler或Avenger开始作为分歧点。

后者的状况是圣杯遭到污染、第四次产生大灾难、第五次时圣杯遭到破坏。前者则是虽没有被污染，但最后大圣杯被达尼克抢走。

哎呀讨厌，爱因兹贝伦不管在哪边都得不到圣杯呢。 [8]

【其他】御三家

在「Apocrypha」，御三家意指发动冬木圣杯战争的魔术师……亦即爱因兹贝伦、远坂与玛奇里。

如同本作提及，玛奇里（间桐）在第三次圣杯战争之际，与达尼克爆发激烈大战的脏砚在大圣杯遭到夺取的冲击下几乎沦为废人。也由于缺乏后继者，魔术师的家系毫无未来可言。

远坂则放弃了大圣杯，一边学习魔术，同时寻找透过拳法与宇宙化为一体之道。双马尾少女在就读高中之际，差点成为「魔术与中国拳法组合而成的全新武术」的开山祖师。可是万万没想到，被远亲收养的妹妹居然会成为超乎想像的肉弹摔跤手，与直卷发少女组成搭档来到日本……！

爱因兹贝伦则认为「既然被抢走，就再制作新的吧」，因此再度努力制作大圣杯。幸好在「Apocrypha」的世界中，死鱼眼佣兵不再与爱因兹贝伦有关，因此最高杰作伊莉雅丝菲尔永远不会诞生——所以只要她不会诞生，爱因兹贝伦就不会绝望……该说幸好吗？